Programma del Corso
Ecologia microbica con protezione dell'ambiente marino.
Il corso fornirà agli studenti elementi conoscitivi su: la diversità dei microrganismi marini, con particolare riferimento ai procarioti e al loro ruolo nell’ambiente marino; le interazioni di alcune specie microbiche con altri organismi marini; i microbi marini e la salute dell’uomo; l’utilità dei microbi marini nelle biotecnologie. Verranno illustrate le tecniche di campionamento ed i principali metodi di studio, classici e molecolari, dell’Ecologia Microbica Marina.
PROGRAMMA ESTESO
Introduzione all'Ecologia microbica marina: temi ed obiettivi
L'ambiente marino e microrganismi
La diversità dei microrganismi
Ruolo biogeochimico dei procarioti negli ambienti marini costieri, di transizione e d’estuario, profondi, idrotermali superficiali e profondi
-Batteri marini: fototrofi (ossigenici ed anossigenici), azoto fissatori, nitrificanti, denitrificanti, anammox; zolfo e ferro ossidanti, solfato-riduttori, metanogeni e metanotrofi, alofili.
-Archea marini: iperalofili, ipertermofili, anammox e metanogeni.
Relazioni tra microrganismi ed altri organismi marini: simbiosi, parassitismo, patogenesi
Batteri luminescenti marini
Microrganismi marini e salute dell’uomo
Il monitoraggio dell’ambiente marino
Biodeterioramento
Microbi marini e Biotecnologie
-Metodi di studio in ecologia microbica marina
Tecniche di campionamento,
Microscopia ottica e ad epifluorescenza,
Metodi classici di coltivazione e di identificazione,
Metodi molecolari per lo studio delle comunità procariotiche.
Biologia delle alghe
Il corso tratta argomenti relativi alla biologia delle divisioni algali. In particolare sono considerati gli aspetti citologici, anatomici e morfologici distintivi dei vari gruppi di micro e macroalghe. Inoltre saranno prese in esame gli aspetti tassonomici e filogenetici di questi organismi. Le lezioni sono integrate da esercitazioni in laboratorio.
PROGRAMMA ESTESO
Introduzione. Cenni sull’inquadramento sistematico degli organismi vegetali marini:
fanerogame marine e alghe. Livelli di organizzazione. Concetto di cormo e tallo. Desmoschisi. Tipi di accrescimento: diffuso e localizzato (apicale, intercalare, basale).
Modelli di costruzione del tallo: simpodiale, monopodiale, dicotomico. Organizzazione unicellulare: coccoide, flagellata. Organizzazione coloniale: tetrasporale, cenobio, pseudofilamentosa, filamentosa. Organizzazione filamentosa: semplice, ramificata, aplostica, polistica, uniassiale, multiassiale, eterotrichia. Organizzazione parenchimatosa. Organizzazione sifonale. Organizzazione cellulare ed infrastrutturale nelle fanerogame marine: parete cellulare, plastidi, anatomia, strutture riproduttive. Organizzazione cellulare ed infrastrutturale nei vari gruppi algali. Interfaccia con l’ambiente: membrana plasmatica, periplasto, pellicola, teca, frustulo, endoscheletro, lorica, parete cellulare. Plastidi: morfologia e ultrastruttura, pirenoide, sostanze di riserva, pigmenti. Nucleo: morfologia e ultrastruttura, modalità di divisione. Flagello: morfologia e ultrastruttura. Strutture riproduttive. Cicli biologici: aplonte, diplonte, aplo-diplonte. Sistematica dei principali gruppi algali. Gerarchia delle categorie sistematiche.Caratteri tassonomici. Concetto di specie
Sistemi di classificazione. Codice di nomenclatura botanica. Principi di classificazione degli organismi vegetali marini. Metodo d’identificazione: uso di chiavi analitiche. Identificazione di rappresentanti dei principali phylum algali.
Course Syllabus
Microbial ecology with the protection of the marine environment.
The course aims to provide basic elements on the following topics:
the diversity of marine microorganisms particularly referred to the prokaryotes; the role of microbes in marine environments; the interactions of some microbial species with other marine organisms; marine microbes and human health; the utility of marine microbes in biotechnologies; sampling techniques and the main classical and molecular methods of study in Marine Microbial Ecology.
Program:
Introduction to marine microbial ecology: themes and objectives
The marine environment and microorganisms
The diversity of microorganisms
Biogeochemical role of prokaryotes in different marine environments: coastal, estuarine, transition, deep, shallow and deep-hydrothermal vents
Marine Bacteria: halophiles, thermophiles, phototrophs, nitrogen fixers, nitrifying, denitrifying, anammox, sulfur, and iron-oxidizing, sulfate reducing, methanogens and methanotrophs.
Archaea: hyperhalophiles, hyperthermophiles, anammox, and methanogens.
Relations between microorganisms and other marine organisms: symbiosis, parasitism, pathogenesis
Luminescent bacteria
Marine organisms and human health
Marine environment monitoring
Biodeterioration
Biotechnologies: enzymes, polymers, and valuable compounds
Methods of study in marine microbial ecology:
Sampling techniques,
Microscopy: optical and epifluorescence,
Classical methods of cultivation and identification.
Molecular identification
Study of prokaryotic community FISH, PCR-DGGE, and metagenomics
Algae Biology.
The course covers topics related to the biology of algal divisions. In particular, the distinctive cytological, anatomical and morphological aspects of the various groups of micro and macroalgae are considered. Furthermore, the taxonomic and phylogenetic aspects of these organisms will be examined. The lessons are supplemented by laboratory exercises.
Program:
Introduction. Notes on the systematics of marine plant organisms: marine phanerogam and algae. Level of organizations: corm and thallus. Desmoschisis. Types of growth: diffused and localized (apical, intercalary, basal). Construction models: monopodial, sympodial and dichotomous developments. Unicellular organization: coccoid, flagellate. colonial organization: tetrasporales, coenobium, pseudofilamentous. Filamentous organization: simple, branched, aplostic, polistic, uniaxial, multi-axial, heterotricheous. Parenchymatous organization. Siphonous organization.
Cellular and infrastructural organization in the various algal groups. Interface with the environment: plasma membrane, periplast, pellicula, teca, frustule, lorica, cell wall. Plastids: morphology and ultrastructure, pyrenoid, reserve substances, pigments. Nucleus: morphology and ultrastructure, division models. Flagella: morphology and ultrastructure. Reproductive structures.
Biological cycles: aplonte, diplonte, aplo-diplonte. Main algal group systematics. Systematic hierarchy. Taxonomic characters. Concept of species.Classification systems. Botanical nomenclature code. Principles of classification of marine plant organisms. Identification method: use of analytical keys. Identification of representatives of the main algal phylum.