Offerta Didattica
BIOLOGIA
GENETICA MOLECOLARE
Classe di corso: LM-6 - Biologia
AA: 2018/2019
Sedi: MESSINA
SSD | TAF | tipologia | frequenza | moduli |
---|---|---|---|---|
BIO/18 | Caratterizzante | Libera | Libera | No |
CFU | CFU LEZ | CFU LAB | CFU ESE | ORE | ORE LEZ | ORE LAB | ORE ESE |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6 | 5 | 1 | 0 | 50 | 40 | 10 | 0 |
LegendaCFU: n. crediti dell’insegnamento CFU LEZ: n. cfu di lezione in aula CFU LAB: n. cfu di laboratorio CFU ESE: n. cfu di esercitazione FREQUENZA:Libera/Obbligatoria MODULI:SI - L'insegnamento prevede la suddivisione in moduli, NO - non sono previsti moduli ORE: n. ore programmate ORE LEZ: n. ore programmate di lezione in aula ORE LAB: n. ore programmate di laboratorio ORE ESE: n. ore programmate di esercitazione SSD:sigla del settore scientifico disciplinare dell’insegnamento TAF:sigla della tipologia di attività formativa TIPOLOGIA:LEZ - lezioni frontali, ESE - esercitazioni, LAB - laboratorio
Obiettivi Formativi
L’Analisi globale in Biologia e l’universo delle discipline ‘omiche’ (genomica, trascrittomica, proteomica). Genomica strutturale: Il genoma umano e la variabilità genomica. Polimorfismi genetici: inserzioni/delezioni, RFLP, STR e VNTR, single nucleotide polymorphisms (SNPs).Learning Goals
.Metodi didattici
Lezioni frontali, esercitazioni in aula, verifiche di apprendimento in itinereTeaching Methods
.Prerequisiti
Risultano consigliate per questo corso le conoscenze di base di biologia, genetica, microbiologia generale e biochimicaPrerequisites
.Verifiche dell'apprendimento
Lezioni frontali, esercitazioni in aula, verifiche di apprendimento in itinereAssessment
.Programma del Corso
Il genoma umano: struttura fisica e contenuto genetico. L’importanza dei progetti genomici: i progetti genoma dedicati agli animali, i progetti genoma dedicati alle piante. Genomica strutturale, genomica funzionale e genomica comparata. Polimorfismi genetici: inserzioni/delezioni, RFLP, STR e VNTR, single nucleotide polymorphisms (SNPs). Metodi per la rivelazione di SNPs o di mutazioni puntiformi. Richiami sulle tecniche di preparazione di genoteche e di sequenziamento di acidi nucleici. Expressed sequence tags (ESTs). Le banche dati di acidi nucleici e di proteine. Allineamento di sequenze di acidi nucleici e proteine. La ricerca in banche dati per similarità (FASTA, BLAST). Annotazione genica; approcci bioinfortmatici e sperimentali. Conoscenze fondamentali su: struttura del gene, promotore e sito di inizio della trascrizione, siti di splicing, sito di poliadenilazione, struttura generale di un mRNA (5’UTR, 3’UTR), splicing alternativo, RNA editing. RNA interference. Conoscenze fondamentali su: regolazione dell’espressione genica; fattori di trascrizione. Metodi di analisi bioinformatica per il riconoscimento di siti di legame per fattori trascrizionali nelle regioni regolatrici. Metodi sperimentali per l’analisi dei siti di regolazione dell’espressione genica. Analisi globale dell’espressione genica: trascritti. Profili di espressione genica mediante ibridazione su DNA microarrays (cDNA o oligonucleotidi): principi e tecniche. SAGE (Serial Analysis of Gene expression). Tecniche di generazione di animali transgenici e knock-out. Approcci sperimentali per lo studio del proteoma: elettroforesi bidimensionale delle proteine; spettrometria di massa: tecnologia MALDI-TOF ed ESI-QTOF. Next Generation Sequencing (NGS): workflow, vantaggi e limiti attuali. - Analisi bioinformatica dei dati NGS e principali formati di file di uso bioinformatico: FASTQ, SAM, GFF3, VCF - Esempi di progetti NGS: Assembly genomico e trascrittomico de novo e reference-guided, Variant Calling, Annotazione di genomi e trascrittomi, Studi epigenetici mediante la metodica Methyl-Seq, Studi di comunità mediante approccio Metagenomico (Target sequencing e Whole Genome Sequencing), Optical MappingCourse Syllabus
.Testi di riferimento: Jeremy W. Dale, Malcolm von Schantz , Nick Plant - Dai Geni ai Genomi - Edises
T.A. Brown – Genomi 3 – Edises
Esami: Elenco degli appelli
Elenco delle unità didattiche costituenti l'insegnamento
GENETICA MOLECOLARE
Docente: ROBERTA GALBO
Orario di Ricevimento - ROBERTA GALBO
Dato non disponibile