Obiettivi Formativi

Il corso vuole fornire gli elementi necessari per conoscere i metodi innovativi per l’identificazione e lo studio dei microrganismi. In particolare, si propone di far acquisire conoscenza e comprensione delle nuove tecnologie molecolari utili per l’analisi di evoluzione e struttura dei microrganismi, per la diagnostica avanzata di infezioni gravi ed emergenti, e per lo studio della resistenza ad antimicrobici e delle interazioni microrganismo-ospite.

Learning Goals

The course aims to provide the necessary elements to learn about molecular methods for the identification and the study of microorganisms. In particular, it aims to provide knowledge and understanding of new molecular technologies useful for analysing evolution and structure of microorganisms, for advanced diagnostics of serious and emerging infections, and for studying antimicrobials-resistance and host-microorganism interactions.

Metodi didattici

Il corso è strutturato in lezioni teoriche frontali, compresi seminari tenuti da esperti, e esercitazioni guidate in laboratorio. La scelta metodologica dell’erogazione della didattica prevede il confronto tra docente e studenti sia durante le lezioni frontali che, particolarmente, durante le esercitazioni. Per i laboratori gli studenti saranno guidati dal docente in tutte le attività pratiche che verranno proposte, e saranno accompagnati alla comprensione e alla corretta interpretazione dei risultati ottenuti dall’esperienza di laboratorio.

Teaching Methods

The course is structured in theoretical lectures, seminars and guided exercises in the laboratory. The methodological choice of teaching provides for the comparison between teacher and students both during the lectures and particularly during the exercises. For the laboratories the students will be guided by the teacher in all the practical activities that will be proposed, and will be accompanied by the understanding and correct interpretation of the results obtained from the laboratory experience

Prerequisiti

Conoscenze di microbiologia generale e molecolare e di biologia molecolare.

Prerequisites

Basic knowledge of general and molecular microbiology, and molecular biology.

Verifiche dell'apprendimento

L’apprendimento verrà verificato tramite un colloquio orale composto da domande atte a valutare il livello di conoscenza ed approfondimento degli argomenti del programma del corso insieme alla competenza di linguaggio e alla capacità di ragionamento sviluppate dallo studente. La valutazione è espressa in trentesimi (voto minimo 18/30). Inoltre, allo scopo di verificare la capacità di apprendimento e le abilità comunicative, a ciascun studente viene proposto di presentare una pubblicazione scientifica contenente argomenti trattati nel corso. Il lavoro viene esposto durante le ultime ore di lezioni frontali del corso e concorre alla votazione finale aumentando fino a tre punti il voto della prova orale.

Assessment

The learning will be verified through an oral interview composed of questions to evaluate the level of knowledge and deepening of the topics of the course program together with the language competence and the reasoning skills developed by the student. The evaluation is expressed in thirtieths (minimum score 18/30). In addition, in order to verify learning ability and communication skills, each student is proposed to present a scientific paper containing topics covered in the course. The work is exposed during the last hours of class and contributes by increasing to the final score by up to three points

Programma del Corso

Metodi di amplificazione degli acidi nucleici e loro potenziali applicazioni in microbiologia. - Tecniche multiplex -Metodi basati sull’utilizzo di sonde e metodi di amplificazione delle molecole sonda in microbiologia diagnostica - Sequenziamento del genoma microbico: applicazioni in microbiologia clinica e salute pubblica -La metagenomica per lo studio dei microrganismi -Tecnologie CRISPR/Cas: strumento di editing del genoma microbico e nuove opportunità diagnostiche - Metodi di base per studiare i virus - Tecniche molecolari per lo studio e lo sviluppo di agenti antivirali - Identificazione molecolare e caratterizzazione di Sars-CoV-2 - Identificazione molecolare e caratterizzazione di HCV - Identificazione molecolare e caratterizzazione di HIV-1 - Identificazione molecolare di papillomavirus umani - Studio dell’interazione microRNA-RNA bersaglio: tecniche molecolari e strumenti di analisi bioinformatica - Sfruttare i profili microRNA (miRNA) per la diagnostica - Manipolazione di microRNA (miRNA) come strategia terapeutica antivirale

Course Syllabus

Nucleic acid amplification methods and their potential application in microbiology - Multiplex technologies - Probe-based methods and probe amplification methods in diagnostic microbiology - Microbial genome sequencing: application in clinical microbiology and public health - Metagenomics for the study of microorganisms - CRISPR/Cas technologies: genome editing tool and new diagnostic opportunities - Methods to study viruses - Molecular techniques for the study and development of antiviral agents - Molecular detection and characterization of hepatitis C virus - Molecular detection and characterization of human immunodeficiency virus type 1 - Molecular detection of human papillomaviruses -Study of microRNA-target RNA interaction: molecular techniques and bioinformatics analysis tools -Exploiting microRNA (miRNA) profiles for diagnostics - MicroRNA manipulation as a host-targeted antiviral therapeutic strategy