Obiettivi Formativi

Il corso fornisce allo studente le conoscenze delle tecnologie high-throughput per identificare i geni che controllano i caratteri produttivi e riproduttivi degli animali in produzione zootecnica, di comprendere le metodologie di genomica strutturale e funzionale per l'analisi del genoma ai fini di migliorare l'efficienza della selezione. L’insegnamento fornisce allo studente le nozioni relative all’utilizzo delle principali risorse bioinformatiche nell'ambito del miglioramento genetico animale che consentono lo studio del genoma delle principali specie zootecniche da reddito.

Learning Goals

The course provides knowledge on high-throughput technologies to identify genes involved in production and reproduction traits in livestock species. It also provides knowledge on methodologies for structural and functional genomics and gene ex-pression; finally knowledge on the most important bioinformatics resources applied to the animal production system.

Metodi didattici

L'insegnamento di “GENOMICA ANIMALE E SELEZIONE ZOOTECNICA”, è costituitò da un unico modulo ripartito in unità didattiche (una teorica ed una di esercitazioni in aulae/o in laboratori). La parte teorica è costituita da lezioni frontali supportate da immagini (slide/filmati), con lo scopo di far acquisire allo studente una serie di informazioni che permettano di valutare i principali aspetti delle produzioni zootecniche. Le attività pratiche prevedono attività di esercitazioni in aula, in laboratorio.

Teaching Methods

The course is represented by lectures with presentation of slides, seminars and discussions with experts and various operators and technicians in the specific field

Prerequisiti

Conoscenze di Anatomia, Fisiologia e Zootecnica generale

Prerequisites

Knowledge of Anatomy, Physiology and Animal Breeding.

Verifiche dell'apprendimento

Il raggiungimento degli obiettivi sarà valutato attraverso un esame orale alla fine del corso. In tale sede, oltre alla conoscenza degli argomenti presenti nel programma lo studente dovrà dimostrare, attraverso lo svolgimento e la soluzione di appositi problemi, di avere acquisito buone capacità di ragionamento e di esposizione.

Assessment

The achievement of the objectives will be assessed through an oral examination at the end of the course. At this moment, in addition to the knowledge of the topics included in the program. The student must demonstrate, through the development and solution of specific problems, to have acquired good reasoning skills and exposure.

Programma del Corso

Didattica Frontale ( 24 ore) Le fasi operative della selezione. Indice di selezione.(4 ore) Principi di genetica molecolare (2 ore) Analisi genomica delle specie di interesse zootecnica e Marcatori genetici in zootecnia (2ore) MAS (Marker Assisted Selection), Geni maggiori, Geni candidati e QTL (Quantitative Trait Loci) (2ore) Studi di associazione Genome-wide per il miglioramento dei caretteri di interesse zootecnico(2ore) Evoluzione e caratteristiche del genoma degli animali di interesse zootecnico: struttura e variabilita' (2ore) Analisi della biodiversità zootecnica (2ore) Tecnologie di sequenziamento high-throughput (2ore) Annotazione di un genoma (2 ore) Principi di bioinformatica (2ore) Banche dati contenenti informazioni sui genomi delle specie di interesse zootecnico (2ore) Didattica Pratica (24 ore) Biosicurezza per l’utilizzo e il funzionamento di un laboratorio di biologia molecolare (1) Estrazione degli acidi nucleici (DNA-RNA) (6) Utilizzo dei principali sofware per l’editing di dati genomici (PLINK, Admixture, BITE (6) Utilizzo di banche dati e software per le analisi genomiche (NCBI, BLAST, Rstudio) (6). Messa a punto di una pipeline per analisi di risequenziamento (FAstaQC, Trimmomatic) (5)

Course Syllabus

Frontal teaching (24 ore) Theory of genetic selection. Selection index. (4 ore) Principles of molecular genetics (2ore) Genomic analysis of livestock species and genetic markers in livestock (2ore) MAS (Marker Assisted Selection), Major genes, candidate genes and QTL (Quantitative Trait Loci) (2ore) Principles of Genome Wide Association studies to improve traits of livestock interest (2ore) Genome's evolution and characteristics of livestock species: structure and variability (2ore) Analyses of animal biodiversity (2ore) High throughput genotyping sequencing (2ore) Genome annotation (2 ore) Principles of bioinformatics (2ore) Databases containing information on the genomes of livestock species (2ore) Practice (24 hours) Biosecurity for the use and operation of a molecular biology laboratory (1) Nucleic acid extraction (DNA-RNA)(6) Use of the main software for editing genomic data (5) Use of databases and software for genomic analyses (6) Messa a punto di una pipeline per analisi di risequenziamento (FAstaQC, Trimmomatic (5)