Obiettivi Formativi

L’insegnamento fornisce agli studenti i concetti avanzati sull’utilizzo di microorganismi nelle biotecnologie, per la prevenzione e la cura di malattie infettive. Questo concetto viene fornito attraverso nozioni volti alla comprensione della selezione, sviluppo, modifica e valutazione di target da impiegare in antibiotico terapia e vaccinoprofilassi. I target sono individuabili attraverso 1) impiego di librerie fagiche, 2) analisi del genoma 3) analisi dei trascritti in vivo, e 4) impiego di ceppi patogeni mutati in vivo. Un ulteriore e importante obiettivo del corso è l'impiego dei microorganismi per individuare geni o sistemi di regolazione di importanti target provenienti dalle applicazioni sopra riportate.

Learning Goals

The course provides advanced concepts about the use of microorganisms in biotechnology, useful to prevention and treatment of infectious diseases. This concept is provided through notions aimed at understanding the selection, development, modification and evaluation of targets to be used in antibiotic therapy and vaccine prophylaxis. The targets are identifiable through 1) use of phage libraries, 2) genome analysis 3) analysis of in vivo transcripts, and 4) use of in vivo mutated pathogenic strains. A further and important objective of the course is the use of microorganisms to identify regulatory genes or systems of important targets coming from the above applications.

Metodi didattici

Lezioni frontali , esercitazioni in laboratorio e strumenti a supporto della didattica come Video didattici e seminari di approfondimento.

Teaching Methods

Frontal lessons, laboratory exercises and teaching aids as Didactic videos and in-depth seminars.

Prerequisiti

Buona conoscenza della microbiologia, della biologia e della biologia molecolare.

Prerequisites

Good knowledge of microbiology, biology and molecular biology.

Verifiche dell'apprendimento

La modalità di verifica dell'apprendimento consiste in un esame orale volto ad accertare una sufficiente conoscenza e padronanza degli argomenti del programma del corso. La valutazione tiene conto del livello di conoscenza e di approfondimento degli argomenti trattati, della capacità di valutazione critica e della capacità di comunicazione.

Assessment

The learning assessment method consists of an oral exam aimed at ascertaining sufficient knowledge and mastery of the topics of the course program. The evaluation takes into account the level of knowledge and in-depth analysis of the topics covered, the critical assessment capacity and the communication skills.

Programma del Corso

- Introduzione alla diagnostica microbiologica. - Scelta dei campioni, tempi, modalità di prelievo e trasporto dei campioni. - Tecniche di coltivazione e isolamento di microrganismi patogeni. - Applicazioni di metodi molecolari (PCR, Multiplex PCR, RT-PCR, Real time PCR, clonaggio, ibridazione degli acidi nucleici) nella diagnosi di infezioni di microrganismi patogeni. - Tecniche molecolari per la differenziazione di ceppi microbici. - Nucleic acid sequence based amplification (NASBA) - Strand Displacement Amplification (SDA) - Branched DNA assay - Transcription Mediated Amplification (TMA) - FilmArray® multiplex PCR - La spettrometria di massa MALDI-TOF nella diagnosi di infezione di microrganismi patogeni - I metodi molecolari utilizzati nella diagnostica e nel monitoraggio delle infezioni: vantaggi e limiti dei test molecolari in microbiologia.

Course Syllabus

- Introduction to microbiological and virological diagnosis - Molecular methods used in the diagnosis and monitoring of infections: advantages and limitations of molecular test in virology and bacteriology - Selection of the samples, timing, methods of sampling and transport of samples - Techniques of cultivation and isolation of pathogenic microorganisms - Applications of molecular methods (PCR, multiplex PCR, RT-PCR, real time PCR, cloning, hybridization of nucleic acids) in the diagnosis of infections caused by pathogenic microorganisms - Molecular techniques for differentiation of microbial strains - Nucleic acid sequence based amplification (NASBA) - Branched DNA assay - Transcription Mediated Amplification (TMA) - Methodical Inno-Lipa