Obiettivi Formativi

Obiettivo del corso è l’acquisizione da parte dello studente delle conoscenze relative alle metodiche di diagnostica molecolare, ai marcatori molecolari dei processi fisiopatologici più importanti, all'utilità dei marcatori molecolari ai fini dello screening, della diagnosi, del monitoraggio della risposta al trattamento, della formulazione della prognosi, e del follow-up.

Learning Goals

The purpose of the bioinorganic chemistry module is to enable the students to acquire basic knowledge related to the molecular diagnostic methods, the molecular markers of prominent pathological conditions, the usefulnes of molecular markers for screening, diagnosis, therapy response monitoring, prognosis, and follow-up.

Metodi didattici

Lezioni frontali in aula con videoproiezione di presentazioni animate con programma Power Point .

Teaching Methods

Lectures with projection of Power Point slides.

Prerequisiti

Conoscenze di biochimica clinica e biologia molecolare clinica.

Prerequisites

Knowledge of clinical biochemistry and clinical molecular biology.

Verifiche dell'apprendimento

Verifica in itinere con test a risposta multipla. Esame orale finale.

Assessment

Ongoing testing with multiple choice test. Final oral examination.

Programma del Corso

La diagnostica molecolare di laboratorio: ruolo delle scienze omiche. Genomica: tipologie ed effetti patologici dei polimorfismi genici; counseling e consenso informato. Tecniche di genomica: isolamento del DNA genomico da campioni biologici, analisi quali-quantitativa del DNA mediante elettroforesi e metodi spettrofotometrici; messa in evidenza di polimorfismi genici mediante sequenziamento diretto del DNA (metodo Sanger), fragment analysis, PCR allele-specifica, reverse dot-blot, discriminazione allelica con Real-time PCR, DHPLC, microarray a oligonucleotidi, e next generation sequencing (NGS); analisi di alterazioni cromosomiche mediante FISH e CGH array. Trascrittomica: analisi dell'espressione genica mediante quantificazione assoluta e relativa dei trascritti genici in Real-time PCR, microarray a cDNA, e NGS. Proteomica: analisi quali-quantitativa di proteine mediante ELISA, RIA, HPLC, protein microarray, elettroforesi 2D, e spettrometria di massa. Cenni di lipidomica. Approfondimento sui marcatori molecolari di alcuni stati patologici: diabete, dislipidemie, malattie cardiovascolari, osteoporosi, patologie tumorali, canalopatie, e malattie autoimmuni. Farmacogenetica.Nutrigenetica.

Course Syllabus

The laboratory of Molecular Diagnostics: role of -omics. Genomics: type and pathogenic role of gene polymorphisms,counseling and informed consent. Genomics techniques: genomic DNA extraction, electrophoresis and spectrophotometric quantification; detection of gene polymorphisms by DNA direct sequencing (Sanger method), fragment analysis, allelic discrimination by Real-time PCR, DHPLC, oligonucleotide microarray, and next generation sequencing (NGS); analysis of chromosomal alterations by FISH and CGH array. Transcriptomics: analysis of gene expression by Real-time PCR- based absolute and relative quantification of gene transcripts, cDNA microarray, and NGS. Proteomics: quali-quantitative analysis of proteins by ELISA, RIA, HPLC, protein microarray, 2D-electrophoresis, and mass spectrometry. Hints of lipidomics. Focus on diagnostic markers of prominent pathological conditions: diabetes, dyslipidemia, cardiovascular disorders, osteoporosis, cancer, channelopathies and autoimmune diseases. Pharmacogenetics. Nutrigenetics.